Leistungsverzeichnis

panel : ID164.02
Achromatopsie (ACHM) : 6 Gene (10,422 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ATF6 616517 AR Achromatopsie (ACHM7) SNV und CNV: Short Read NGS
CNGA3 216900 AR Achromatopsie (ACHM2) SNV und CNV: Short Read NGS
CNGB3 262300 AR Achromatopsie (ACHM3) SNV und CNV: Short Read NGS
GNAT2 613856 AR Achromatopsie (ACHM4) SNV und CNV: Short Read NGS
PDE6C 613093 AR Achromatopsie (ACHM5) SNV und CNV: Short Read NGS
PDE6H 610024 AR Achromatopsie (ACHM6) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Achromatopsie (ACHM)
ATF6, CNGA3, CNGB3, GNAT2, PDE6C, PDE6H
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ATF6, CNGA3, CNGB3, GNAT2, PDE6C, PDE6H
HPO Terms
Achromatopsia, Dyschromatopsia, Photophobia, Reduced visual acuity, Nystagmus, Pendular nystagmus, Central scotoma, Abnormal full-field electroretinogram, Undetectable light-adapted electroretinogram, Cone/cone-rod dystrophy, Cone dystrophy, Abnormal light-adapted flicker electroretinogram, Abnormal electroretinogram, Childhood onset, Juvenile onset, Absent foveal reflex, Color vision test abnormality, Abnormal foveal morphology, Abnormal macular morphology, Abnormality of retinal pigmentation
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