Leistungsverzeichnis

panel : ID182.03
Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD) : 11 Gene (21,486 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
B3GLCT 261540 AR Peters-Plus-Syndrom (PTRPLS) SNV und CNV: Short Read NGS
CPAMD8 617319 AR Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD8) SNV und CNV: Short Read NGS
CYP1B1 617315 AR Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD6) SNV und CNV: Short Read NGS
ELP4 617141 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (AN2) SNV und CNV: Short Read NGS
FOXC1 601631 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD3) SNV und CNV: Short Read NGS
FOXE3 610256 AR Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD2) SNV und CNV: Short Read NGS
PAX6 604229 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD5) SNV und CNV: Short Read NGS
PITX2 137600 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD4) SNV und CNV: Short Read NGS
PITX3 107250 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD1) SNV und CNV: Short Read NGS
PXDN 269400 AR Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (ASGD7) SNV und CNV: Short Read NGS
TRIM44 617142 AD Dysgenesie des vorderen Augensegmentes (AN3) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Peters-Anomalie
B3GLCT, CYP1B1, FOXC1, FOXE3, PAX6, PITX2, PITX3
Axenfeld-Rieger-Anomalie (RIEG)
FOXC1, PAX6, PITX2
Aniridie (AN)
ELP4, PAX6, TRIM44
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
B3GLCT, CPAMD8, CYP1B1, ELP4, FOXC1, FOXE3, PAX6, PITX2, PITX3, PXDN, TRIM44
HPO Terms
Peters anomaly, Axenfeld anomaly, Rieger anomaly, Aniridia, Congenital aphakia, Microphthalmia, Microcornea, Corneal opacity, Cataract, Lens coloboma, Iris coloboma, Hypoplasia of the iris, Anterior segment of eye aplasia, Abnormal anterior chamber morphology, Abnormal cornea morphology, Abnormal iris morphology, Anterior synechiae of the anterior chamber, Posterior synechiae of the anterior chamber, Abnormal corneal limbus morphology, Hypoplasia of the iris stroma
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