Leistungsverzeichnis

panel : ID331.01
Kongenitaler Nystagmus (NYS) : 31 Gene (71,010 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
AHR 620958 AR Foveahypoplasie (FVH3) SNV und CNV: Short Read NGS
ATF6 616517 AR Achromatopsie (ACHM7) SNV und CNV: Short Read NGS
CACNA1F 300600 XL Kongenitale stationäre Nachtblindheit (CSNB2B) SNV und CNV: Short Read NGS
CEP290 611755 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA10) SNV und CNV: Short Read NGS
CNGA3 216900 AR Achromatopsie (ACHM2) SNV und CNV: Short Read NGS
CNGB3 262300 AR Achromatopsie (ACHM3) SNV und CNV: Short Read NGS
CRB1 613835 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA8) SNV und CNV: Short Read NGS
CRX 613829 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA7) SNV und CNV: Short Read NGS
DAGLA 168885 AD Neurookuläres Syndrom (NOC2) SNV und CNV: Short Read NGS
DCT 619165 AR Okulokutaner Albinismus (OCA8) SNV und CNV: Short Read NGS
FRMD7 310700 XL Kongenitaler Nystagmus (NYS1) SNV und CNV: Short Read NGS
GPR143 300814 XLR Kongenitaler Nystagmus (NYS6) SNV und CNV: Short Read NGS
GUCY2D 204000 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA1) SNV und CNV: Short Read NGS
IMPDH1 613837 AD Lebersche kongenitale Amaurose (LCA11) SNV und CNV: Short Read NGS
KCNJ13 614186 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA16) SNV und CNV: Short Read NGS
LCA5 604837 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA5) SNV und CNV: Short Read NGS
LRAT 613341 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA14) SNV und CNV: Short Read NGS
LRMDA 615179 AR Okulokutaner Albinismus (OCA7) SNV und CNV: Short Read NGS
NMNAT1 608553 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA9) SNV und CNV: Short Read NGS
NYX 310500 XLR Kongenitale stationäre Nachtblindheit (CSNB1A) SNV und CNV: Short Read NGS
OCA2 203200 AR Okulokutaner Albinismus (OCA2) SNV und CNV: Short Read NGS
PAX6 136520 AD Foveahypoplasie (FVH1) SNV und CNV: Short Read NGS
ROBO1 620958 AR Kongenitaler Nystagmus (NYS8) SNV und CNV: Short Read NGS
RPE65 204100 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA2) SNV und CNV: Short Read NGS
RPGRIP1 613826 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA6) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC24A5 113750 AR Okulokutaner Albinismus (OCA6) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC38A8 609218 AR Foveahypoplasie (FVH2) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC45A2 606574 AR Okulokutaner Albinismus (OCA4) SNV und CNV: Short Read NGS
TULP1 613843 AR Lebersche kongenitale Amaurose (LCA15) SNV und CNV: Short Read NGS
TYR 203100 AR Okulokutaner Albinismus (OCA1) SNV und CNV: Short Read NGS
TYRP1 203290 AR Okulokutaner Albinismus (OCA3) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Nystagmus, nicht-syndromal (NYS)
FRMD7, GPR143, ROBO1
Foveahypoplasie, nicht-syndromal (FVH)
AHR, PAX6, SLC38A8
Okulokutaner Albinismus (OCA)
DCT, LRMDA, OCA2, SLC24A5, SLC45A2, TYR, TYRP1
Lebersche kongenitale Amaurose (LCA)
CEP290, CRB1, CRX, GUCY2D, IMPDH1, KCNJ13, LCA5, LRAT, NMNAT1, RPE65, RPGRIP1, TULP1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
AHR, ATF6, CACNA1F, CEP290, CNGA3, CNGB3, CRB1, CRX, DAGLA, DCT, FRMD7, GPR143, GUCY2D, IMPDH1, KCNJ13, LCA5, LRAT, LRMDA, NMNAT1, NYX, OCA2, PAX6, ROBO1, RPE65, RPGRIP1, SLC24A5, SLC38A8, SLC45A2, TULP1, TYR, TYRP1
HPO Terms
Nystagmus, Congenital onset, Infantile onset, Horizontal nystagmus, Pendular nystagmus, Conjugated nystagmus, Abnormal head posture, Decreased visual acuity, Reduced visual acuity, Vision impairment, Photophobia, Optic nerve hypoplasia, Retinal dystrophy, Cone-rod dystrophy, Achromatopsia, Aniridia, Ocular albinism, Retinitis pigmentosa, Congenital stationary night blindness, Abnormal eye movement
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