Leistungsverzeichnis - Walker-Warburg-Syndrom (WWS, MDDGA) : 14 Gene (23,712 kb)

Material	Dauer	Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut	3 - 5 Wochen	ja

Untersuchte Bereiche / Gene

Genotyp	OMIM-P	Erbgang	Phänotyp	Methodik
B3GALNT2	615181	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA11)	SNV und CNV: Short Read NGS
B4GAT1	515287	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA13)	SNV und CNV: Short Read NGS
CRPPA	614643	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA7)	SNV und CNV: Short Read NGS
DAG1	616538	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA9)	SNV und CNV: Short Read NGS
FKRP	613153	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA5)	SNV und CNV: Short Read NGS
FKTN	253800	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA4)	SNV und CNV: Short Read NGS
GMPPB	615350	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA14)	SNV und CNV: Short Read NGS
LARGE1	613154	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA6)	SNV und CNV: Short Read NGS
POMGNT1	253280	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA3)	SNV und CNV: Short Read NGS
POMGNT2	614830	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA8)	SNV und CNV: Short Read NGS
POMK	615249	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA12)	SNV und CNV: Short Read NGS
POMT1	236670	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA1)	SNV und CNV: Short Read NGS
POMT2	613150	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA2)	SNV und CNV: Short Read NGS
RXYLT1	615041	AR	Muskeldystrophie-Dystroglykanopathie mit Hirn- und Augenanomalien (MDDGA10)	SNV und CNV: Short Read NGS

Methodik

ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.

Walker-Warburg-Syndrom (WWS, MDDGA)

B3GALNT2, B4GAT1, CRPPA, DAG1, FKRP, FKTN, GMPPB, LARGE1, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, RXYLT1

Kosten

Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.

Gesamte Genliste

B3GALNT2, B4GAT1, CRPPA, DAG1, FKRP, FKTN, GMPPB, LARGE1, POMGNT1, POMGNT2, POMK, POMT1, POMT2, RXYLT1

HPO Terms

Muscular hypotonia, Severe global developmental delay, Intellectual disability, Lissencephaly, Cerebellar hypoplasia, Hydrocephalus, Cerebral cortical dysplasia, Ventriculomegaly, Optic nerve hypoplasia, Retinal dystrophy, Coloboma, Cataract, Seizure, Hypertonia, Spasticity, Elevated creatine kinase, Muscle weakness, Abnormal ocular motility, Developmental delay, Contractures