Leistungsverzeichnis - Loeys-Dietz-Syndrom (LDS) und ähnliche Aortenerkrankungen : 40 Gene (117,251 kb)

Material	Dauer	Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut	4 - 6 Wochen	ja

Untersuchte Bereiche / Gene

Genotyp	OMIM-P	Erbgang	Phänotyp	Methodik
ACTA2	611788	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT6)	SNV und CNV: Short Read NGS
AEBP1	618000	AR	EDS, klassisch-ähnlicher Typ (EDSCLL2)	SNV und CNV: Short Read NGS
ALDH18A1	616603	AD	Cutis laxa (ADCL3)	SNV und CNV: Short Read NGS
BGN	300989	XL	Meester-Loeys-Syndrom (MRLS)	SNV und CNV: Short Read NGS
C1R	130080	AD	EDS, Parodontitis-Typ (EDSPD1)	SNV und CNV: Short Read NGS
C1S	617174	AD	EDS, Parodontitis-Typ (EDSPD2)	SNV und CNV: Short Read NGS
COL1A2	225320	AR	EDS, Herzklappen-Typ (EDSCV)	SNV und CNV: Short Read NGS
COL3A1	130050	AD	EDS, vaskulärer Typ (EDSVASC)	SNV und CNV: Short Read NGS
COL5A1	130000	AD	EDS, klassischer Typ (EDSCL1)	SNV und CNV: Short Read NGS
COL5A2	130010	AD	EDS, klassischer Typ (EDSCL2)	SNV und CNV: Short Read NGS
EFEMP2	614437	AR	Cutis laxa (ARCL1B)	SNV und CNV: Short Read NGS
ELN	123700	AD	Cutis laxa (ADCL1)	SNV und CNV: Short Read NGS
FBLN5	219100	AR	Cutis laxa (ARCL1A)	SNV und CNV: Short Read NGS
FBLN5	614434	AD	Cutis laxa (ADCL2)	SNV und CNV: Short Read NGS
FBN1	154700	AD	Marfan-Syndrom (MFS)	SNV und CNV: Short Read NGS
FBN1	154700	AD	Marfan-Syndrom (MFS)	SNV und CNV: Short Read NGS
FKBP14	614557	AR	EDS, Kyphoskoliose-Typ (EDSKSCL2)	SNV und CNV: Short Read NGS
FLNA	314400	XL	Herzklappen-Dysplasie (CVD1)	SNV und CNV: Short Read NGS
FOXE3	617349	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT11)	SNV und CNV: Short Read NGS
IPO8	619472	AR	VISS-Syndrom (VISS)	SNV und CNV: Short Read NGS
LOX	617168	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT10)	SNV und CNV: Short Read NGS
LTBP4	613177	AR	Cutis laxa (ARCL1C)	SNV und CNV: Short Read NGS
MAT2A	601468	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT)	SNV und CNV: Short Read NGS
MFAP5	616166	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT9)	SNV und CNV: Short Read NGS
MYH11	132900	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT4)	SNV und CNV: Short Read NGS
MYLK	613780	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT7)	SNV und CNV: Short Read NGS
NOTCH1	109730	AD	Aortenklappenerkrankung (AOVD1)	SNV und CNV: Short Read NGS
PLOD1	225400	AR	EDS, Kyphoskoliose-Typ (EDSKSCL1)	SNV und CNV: Short Read NGS
PRKG1	615436	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT8)	SNV und CNV: Short Read NGS
ROBO4	618496	AD	Aortenklappenerkrankung (AOVD3)	SNV und CNV: Short Read NGS
SKI	182212	AD	Shprintzen-Goldberg-Syndrom (SGS)	SNV und CNV: Short Read NGS
SLC2A10	208050	AR	Arterial-Tortuosity-Syndrom (ATORS)	SNV und CNV: Short Read NGS
SMAD2	619656	AD	Loeys-Dietz-Syndrom (LDS6)	SNV und CNV: Short Read NGS
SMAD3	613795	AD	Loeys-Dietz-Syndrom (LDS3)	SNV und CNV: Short Read NGS
SMAD4	175050	AD	JP/HHT-Syndrom (JPHT)	SNV und CNV: Short Read NGS
SMAD6	614823	AD	Aortenklappenerkrankung (AOVD2)	SNV und CNV: Short Read NGS
TGFB2	614816	AD	Loeys-Dietz-Syndrom (LDS4)	SNV und CNV: Short Read NGS
TGFB3	615582	AD	Loeys-Dietz-Syndrom (LDS5)	SNV und CNV: Short Read NGS
TGFBR1	609192	AD	Loeys-Dietz-Syndrom (LDS1)	SNV und CNV: Short Read NGS
TGFBR1	609192	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT5)	SNV und CNV: Short Read NGS
TGFBR2	610168	AD	Loeys-Dietz-Syndrom (LDS2)	SNV und CNV: Short Read NGS
TGFBR2	610168	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT3)	SNV und CNV: Short Read NGS
THSD4	619825	AD	Thorakales Aortenaneurysma (AAT12)	SNV und CNV: Short Read NGS

Methodik

ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.

Loeys-Dietz-Syndrom (LDS)

BGN, IPO8, SMAD2, SMAD3, TGFB2, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2

Thorakales Aortenaneurysma, nicht-syndromal (AAT)

ACTA2, FOXE3, LOX, MAT2A, MFAP5, MYH11, MYLK, PRKG1, TGFBR1, TGFBR2, THSD4

Thorakales Aortenaneurysma, syndromal

AEBP1, ALDH18A1, BGN, C1R, C1S, COL1A2, COL3A1, COL5A1, COL5A2, EFEMP2, ELN, FBLN5, FBN1, FBN2, FKBP14, FLNA, IPO8, LTBP4, NOTCH1, PLOD1, ROBO4, SKI, SLC2A10, SMAD2, SMAD3, SMAD4, SMAD6, TGFB2, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2

Kosten

Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.

Gesamte Genliste

ACTA2, AEBP1, ALDH18A1, BGN, C1R, C1S, COL1A2, COL3A1, COL5A1, COL5A2, EFEMP2, ELN, FBLN5, FBN1, FBN2, FKBP14, FLNA, FOXE3, IPO8, LOX, LTBP4, MAT2A, MFAP5, MYH11, MYLK, NOTCH1, PLOD1, PRKG1, ROBO4, SKI, SLC2A10, SMAD2, SMAD3, SMAD4, SMAD6, TGFB2, TGFB3, TGFBR1, TGFBR2, THSD4