Leistungsverzeichnis

panel : ID078.06
Primäre und prämature Ovarialinsuffizienz (POI, POF) : 40 Gene (88,500 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
BMP15 300510 XL Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF4) SNV und CNV: Short Read NGS
BMP15 300510 XL Ovarialdysgenesie (ODG2) SNV und CNV: Short Read NGS
BNC1 618723 AD Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF16) SNV und CNV: Short Read NGS
C14orf39 619203 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF18) SNV und CNV: Short Read NGS
DIAPH2 300511 XLD Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF2A) SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC6 616946 AD Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF11) SNV und CNV: Short Read NGS
ESR2 618187 AD Ovarialdysgenesie (ODG8) SNV und CNV: Short Read NGS
ESR2 619665 AR Ovarialdysgenesie (ODG9) SNV und CNV: Short Read NGS
FANCM 618096 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF15) SNV und CNV: Short Read NGS
FIGLA 612310 AD Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF6) SNV und CNV: Short Read NGS
FMR1 311360 XL Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF1) SNV und CNV: Short Read NGS
FOXL2 608996 AD Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF3) SNV und CNV: Short Read NGS
FSHR 233300 AR Ovarialdysgenesie (ODG1) SNV und CNV: Short Read NGS
GDF9 618014 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF14) SNV und CNV: Short Read NGS
HFM1 615724 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF9) SNV und CNV: Short Read NGS
HROB 620897 AR Ovarialdysgenesie (ODG11) SNV und CNV: Short Read NGS
HSF2BP 619245 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF19) SNV und CNV: Short Read NGS
INHA 147380 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF) SNV und CNV: Short Read NGS
KASH5 620548 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF22) SNV und CNV: Short Read NGS
LHCGR 238320 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF) SNV und CNV: Short Read NGS
MCM8 612885 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF10) SNV und CNV: Short Read NGS
MCM9 616185 AR Ovarialdysgenesie (ODG4) SNV und CNV: Short Read NGS
MEIOB 620686 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF23) SNV und CNV: Short Read NGS
MGA 621065 AD Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF26) SNV und CNV: Short Read NGS
MRPS22 618117 AR Ovarialdysgenesie (ODG7) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH4 609938 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF20) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH5 617442 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF13) SNV und CNV: Short Read NGS
NHEJ1 311360 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF) SNV und CNV: Short Read NGS
NOBOX 611548 AD Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF5) SNV und CNV: Short Read NGS
NR5A1 612964 AD Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF7) SNV und CNV: Short Read NGS
NUP107 618078 AR Ovarialdysgenesie (ODG6) SNV und CNV: Short Read NGS
POF1B 300604 XLR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF2B) SNV und CNV: Short Read NGS
PSMC3IP 614324 AR Ovarialdysgenesie (ODG3) SNV und CNV: Short Read NGS
SOHLH1 617690 AR Ovarialdysgenesie (ODG5) SNV und CNV: Short Read NGS
SPATA22 621002 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF25) SNV und CNV: Short Read NGS
STAG3 615723 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF8) SNV und CNV: Short Read NGS
SYCE1 616947 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF12) SNV und CNV: Short Read NGS
SYCP2L 620840 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF24) SNV und CNV: Short Read NGS
TP63 620311 AD Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF21) SNV und CNV: Short Read NGS
XRCC2 619146 AR Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF17) SNV und CNV: Short Read NGS
ZSWIM7 619834 AR Ovarialdysgenesie (ODG10) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Vorzeitige Ovarialinsuffizienz (POF)
BNC1, C14orf39, DIAPH2, ERCC6, FANCM, FIGLA, FMR1, FOXL2, GDF9, HFM1, HSF2BP, KASH5, MCM8, MEIOB, MGA, MSH4, MSH5, NOBOX, NR5A1, POF1B, SPATA22, STAG3, SYCE1, SYCP2L, TP63, XRCC2
Ovarialdysgenesie (ODG)
BMP15, ESR2, FSHR, HROB, MCM9, MRPS22, NUP107, PSMC3IP, SOHLH1, SPIDR, ZSWIM7
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
BMP15, BNC1, C14orf39, DIAPH2, ERCC6, ESR2, FANCM, FIGLA, FMR1, FOXL2, FSHR, GDF9, HFM1, HROB, HSF2BP, INHA, KASH5, LHCGR, MCM8, MCM9, MEIOB, MGA, MRPS22, MSH4, MSH5, NHEJ1, NOBOX, NR5A1, NUP107, POF1B, PSMC3IP, SOHLH1, SPATA22, SPIDR, STAG3, SYCE1, SYCP2L, TP63, XRCC2, ZSWIM7
HPO Terms
Primary amenorrhea, Secondary amenorrhea, Premature ovarian insufficiency, Hypergonadotropic hypogonadism, Elevated follicle stimulating hormone level, Elevated luteinizing hormone level, Decreased serum estradiol level, Decreased antral follicle count, Streak ovary, Gonadal dysgenesis, Ovarian dysgenesis, Ovarian hypoplasia, Ovarian failure, Female infertility, Decreased fertility, Decreased fertility in females, Premature menopause, Ovarian follicular depletion, Premature ovarian failure, Ovarian agenesis
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