Leistungsverzeichnis

panel : ID208.01
Fokale Epilepsien : 17 Gene (51,017 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
CHRNA2 610353 AD Nächtliche Frontallappenepilepsie (ENFL4) SNV und CNV: Short Read NGS
CHRNA4 600513 AD Nächtliche Frontallappenepilepsie (ENFL1) SNV und CNV: Short Read NGS
CHRNB2 605375 AD Nächtliche Frontallappenepilepsie (ENFL3) SNV und CNV: Short Read NGS
CNTNAP2 610042 AR Kortikale Dysplasie-Fokale Epilepsie-Syndrom (CDFES) SNV und CNV: Short Read NGS
CPA6 614417 AD Temporallappenepilepsie (ETL5) SNV und CNV: Short Read NGS
DEPDC5 604364 AD Fokale Epilepsie mit variablen Herden (FFEVF1) SNV und CNV: Short Read NGS
GAL 616461 AD Temporallappenepilepsie (ETL8) SNV und CNV: Short Read NGS
GRIN2A 245520 AD Fokale Epilepsie mit Sprachstörungen (FESD) SNV und CNV: Short Read NGS
GRIN2A 245520 AD Rolando-Epilepsie, mentale Retardierung und Sprechdyspraxie (RESDAD) SNV und CNV: Short Read NGS
KCNT1 615005 AD Nächtliche Frontallappenepilepsie (ENFL5) SNV und CNV: Short Read NGS
LGI1 600512 AD Temporallappenepilepsie (ETL1) SNV und CNV: Short Read NGS
NPRL2 617116 AD Fokale Epilepsie mit variablen Herden (FFEVF2) SNV und CNV: Short Read NGS
NPRL3 617118 AD Fokale Epilepsie mit variablen Herden (FFEVF3) SNV und CNV: Short Read NGS
PCDH19 300088 XL Fokale Epilepsie mit mentaler Retardierung (EFMR) SNV und CNV: Short Read NGS
RELN 616436 AD Temporallappenepilepsie (ETL7) SNV und CNV: Short Read NGS
SCN3A 617935 AD Fokale Epilepsie mit variablen Herden (FFEVF4) SNV und CNV: Short Read NGS
SRPX2 300643 XL Rolando-Epilepsie, mentale Retardierung und Sprechdyspraxie (RESDX) SNV und CNV: Short Read NGS
TBC1D24 608105 AR Rolando-Epilepsie, Dystonie und Schreibkrämpfe (EPRPDC) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Fokale Epilepsie mit variablen Herden (FFEVF)
DEPDC5, NPRL2, NPRL3, SCN3A
Nächtliche Frontallappenepilepsie (ENFL)
CHRNA2, CHRNA4, CHRNB2, DEPDC5, KCNT1
Temporallappenepilepsie (ETL)
CPA6, GAL, LGI1, RELN
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
CHRNA2, CHRNA4, CHRNB2, CNTNAP2, CPA6, DEPDC5, GAL, GRIN2A, KCNT1, LGI1, NPRL2, NPRL3, PCDH19, RELN, SCN3A, SRPX2, TBC1D24
HPO Terms
Focal seizures,Focal-onset seizure,Focal aware seizure,Focal impaired awareness seizure,Focal autonomic seizure,Focal motor seizure,Focal myoclonic seizure,Focal tonic seizure,Focal clonic seizure,Focal hemiclonic seizure,Focal hemifacial clonic seizure,Focal epileptiform discharges,Focal seizures with focal onset,Bilateral tonic-clonic seizure with focal onset,Focal cortical dysplasia,Focal cortical dysplasia type I,Focal cortical dysplasia type II,Focal cortical dysplasia type IIa,Focal seizure with aura,Focal seizure with automatisms
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