Leistungsverzeichnis

panel : ID146.01
Hypotrichose, nicht-syndromale Form (HYPT) : 12 Gene (20,127 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
APCDD1 605389 AD HYPT1 SNV und CNV: Short Read NGS
CDSN 146520 AD HYPT2 SNV und CNV: Short Read NGS
DSG4 607903 AR HYPT6 SNV und CNV: Short Read NGS
EPS8L3 612841 AD HYPT5 SNV und CNV: Short Read NGS
HR 146550 AD HYPT4 SNV und CNV: Short Read NGS
KRT71 615896 AD HYPT13 SNV und CNV: Short Read NGS
KRT74 613981 AD HYPT3 SNV und CNV: Short Read NGS
LIPH 604379 AR HYPT7 SNV und CNV: Short Read NGS
LPAR6 278150 AR HYPT8 SNV und CNV: Short Read NGS
LSS 618275 AR HYPT14 SNV und CNV: Short Read NGS
RPL21 615885 AD HYPT12 SNV und CNV: Short Read NGS
SNRPE 615059 AD HYPT11 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Hypotrichose, nicht-syndromale Form (HYPT)
APCDD1, CDSN, DSG4, EPS8L3, HR, KRT71, KRT74, LIPH, LPAR6, LSS, RPL21, SNRPE
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
APCDD1, CDSN, DSG4, EPS8L3, HR, KRT71, KRT74, LIPH, LPAR6, LSS, RPL21, SNRPE
HPO Terms
Hypotrichosis, Sparse scalp hair, Sparse eyebrows, Sparse eyelashes, Sparse body hair, Sparse axillary hair, Sparse pubic hair, Absent scalp hair, Absent eyebrows, Absent eyelashes, Fine hair, Brittle hair, Slow-growing scalp hair, Slow-growing hair, Abnormal hair texture, Dry hair, Woolly hair, Coarse hair, Sparse hair, Pili torti
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