Leistungsverzeichnis

panel : ID372.00
Primäres Lymphödem (LMPHM) : 21 Gene (69,402 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ADAMTS3 618154 AD Hennekam Lymphangiektasie-Lymphödem-Syndrom (HKLLS3) SNV und CNV: Short Read NGS
ANGPT2 610369 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM10) SNV und CNV: Short Read NGS
CALCRL 618773 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM8) SNV und CNV: Short Read NGS
CCBE1 618154 AR Hennekam Lymphangiektasie-Lymphödem-Syndrom (HKLLS1) SNV und CNV: Short Read NGS
CELSR1 619319 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM9) SNV und CNV: Short Read NGS
EPHB4 617300 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM7) SNV und CNV: Short Read NGS
ERG 620602 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM14) SNV und CNV: Short Read NGS
FAT4 616006 AR Hennekam Lymphangiektasie-Lymphödem-Syndrom (HKLLS2) SNV und CNV: Short Read NGS
FLT4 153100 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM1) SNV und CNV: Short Read NGS
FOXC2 153400 AR Lymphödem-Distichiasis-Syndrom (LPHDST) SNV und CNV: Short Read NGS
GATA2 614038 AD Primäres Lymphödem mit Myelodysplasie SNV und CNV: Short Read NGS
GJA1 121014 AD Okulodentodigitale Dysplasie mit Lymphödem (ODDD) SNV und CNV: Short Read NGS
GJC2 613480 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM3) SNV und CNV: Short Read NGS
KIF11 152950 AD Mikrozephalie, Lymphödem und Chorioretinopathie (MCLMR) SNV und CNV: Short Read NGS
MDFIC 620014 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM12) SNV und CNV: Short Read NGS
PIEZO1 616843 AR Lymphatische Fehlbildung (LMPHM6) SNV und CNV: Short Read NGS
PTPN14 613611 AR Choanatresie mit Lymphödem (CATLPH) SNV und CNV: Short Read NGS
SOX18 607823 AR Hypotrichose-Lymphödem-Teleangiektasie-Syndrom (HLTS) SNV und CNV: Short Read NGS
THSD1 616821 AR Lymphatische Fehlbildung (LMPHM13) SNV und CNV: Short Read NGS
TIE1 619401 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM11) SNV und CNV: Short Read NGS
VEGFC 615907 AD Lymphatische Fehlbildung (LMPHM4) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Primäres Lymphödem (LMPHM)
ADAMTS3, ANGPT2, CALCRL, CCBE1, CELSR1, EPHB4, ERG, FAT4, FLT4, FOXC2, GATA2, GJA1, GJC2, KIF11, MDFIC, PIEZO1, PTPN14, SOX18, THSD1, TIE1, VEGFC
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ADAMTS3, ANGPT2, CALCRL, CCBE1, CELSR1, EPHB4, ERG, FAT4, FLT4, FOXC2, GATA2, GJA1, GJC2, KIF11, MDFIC, PIEZO1, PTPN14, SOX18, THSD1, TIE1, VEGFC
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