Leistungsverzeichnis

panel : ID023.06
Noonan-Syndrom (NS) : 16 Gene (27,387 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
BRAF 613706 AD Noonan-Syndrom (NS7) SNV und CNV: Short Read NGS
CBL 613563 AD Noonan-Syndrom-ähnliche Erkrankung (NSLL) SNV und CNV: Short Read NGS
KRAS 609942 AD Noonan-Syndrom (NS3) SNV und CNV: Short Read NGS
LZTR1 605275 AR Noonan-Syndrom (NS2) SNV und CNV: Short Read NGS
LZTR1 616504 AD Noonan-Syndrom (NS10) SNV und CNV: Short Read NGS
MAPK1 619087 AD Noonan-Syndrom (NS13) SNV und CNV: Short Read NGS
MRAS 618499 AD Noonan-Syndrom (NS11) SNV und CNV: Short Read NGS
NRAS 613224 AD Noonan-Syndrom (NS6) SNV und CNV: Short Read NGS
PPP1CB 617506 AD Noonan-Syndrom-ähnliche Erkrankung (NSLH2) SNV und CNV: Short Read NGS
PTPN11 163950 AD Noonan-Syndrom (NS1) SNV und CNV: Short Read NGS
RAF1 611553 AD Noonan-Syndrom (NS5) SNV und CNV: Short Read NGS
RIT1 615355 AD Noonan-Syndrom (NS8) SNV und CNV: Short Read NGS
RRAS2 618624 AD Noonan-Syndrom (NS12) SNV und CNV: Short Read NGS
SHOC2 607721 AD Noonan-Syndrom-ähnliche Erkrankung (NSLH1) SNV und CNV: Short Read NGS
SOS1 610733 AD Noonan-Syndrom (NS4) SNV und CNV: Short Read NGS
SOS2 616559 AD Noonan-Syndrom (NS9) SNV und CNV: Short Read NGS
SPRED2 619745 AR Noonan-Syndrom (NS14) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Noonan-Syndrom (NS)
BRAF, CBL, KRAS, LZTR1, LZTR1, MAPK1, MRAS, NRAS, PPP1CB, PTPN11, RAF1, RIT1, RRAS2, SHOC2, SOS1, SOS2, SPRED2
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
BRAF, CBL, KRAS, LZTR1, MAPK1, MRAS, NRAS, PPP1CB, PTPN11, RAF1, RIT1, RRAS2, SHOC2, SOS1, SOS2, SPRED2
HPO Terms
Short stature, Growth delay, Hypertelorism, Downslanted palpebral fissures, Ptosis, Broad forehead, Webbed neck, Low posterior hairline, Low-set ears, Scoliosis, Pectus excavatum, Pectus carinatum, Hypertrophic cardiomyopathy, Pulmonary valve stenosis, Atrial septal defect, Ventricular septal defect, Tricuspid regurgitation, Cryptorchidism, Intellectual disability, mild
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