Leistungsverzeichnis

panel : ID357.01
Knochenmarkversagen (BMF) : 28 Gene (47,631 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ACD 616553 AR Dyskeratosis congenita (DKCB7) SNV und CNV: Short Read NGS
ADH5 619151 DD Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS7) SNV und CNV: Short Read NGS
ALDH2 619151 DD Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS7) SNV und CNV: Short Read NGS
DCLRE1B 620133 AR Dyskeratosis congenita (DKCB8) SNV und CNV: Short Read NGS
DKC1 305000 XLR Dyskeratosis congenita (DKCX) SNV und CNV: Short Read NGS
DNAJC21 617052 AR Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS3) SNV und CNV: Short Read NGS
DUT 620044 AR Knochenmarkinsuffizienz und Diabetes mellitus (BMFDMS) SNV und CNV: Short Read NGS
EFL1 617941 AR Shwachman-Diamond-Syndrom (SDS2) SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC6L2 615715 AR Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS2) SNV und CNV: Short Read NGS
MDM4 618849 AD Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS6) SNV und CNV: Short Read NGS
MYSM1 618116 AR Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS4) SNV und CNV: Short Read NGS
NAF1 620365 AD Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT7) SNV und CNV: Short Read NGS
NHP2 613987 AR Dyskeratosis congenita (DKCB2) SNV und CNV: Short Read NGS
NOP10 620400 AD Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT9) SNV und CNV: Short Read NGS
NOP10 224230 AR Dyskeratosis congenita (DKCB1) SNV und CNV: Short Read NGS
PARN 616371 AD Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT4) SNV und CNV: Short Read NGS
PARN 616353 AR Dyskeratosis congenita (DKCB6) SNV und CNV: Short Read NGS
POT1 620367 AD Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT8) SNV und CNV: Short Read NGS
RPA1 619767 AD Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT6) SNV und CNV: Short Read NGS
RTEL1 616373 AD Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT3) SNV und CNV: Short Read NGS
RTEL1 615190 AR Dyskeratosis congenita (DKCB5) SNV und CNV: Short Read NGS
SBDS 260400 AR Shwachman-Diamond-Syndrom (SDS1) SNV und CNV: Short Read NGS
SLC30A7 620501 AR Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS8) SNV und CNV: Short Read NGS
SRP72 614675 AD Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS1) SNV und CNV: Short Read NGS
TERC 614743 AD Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT2) SNV und CNV: Short Read NGS
TERT 614742 AD Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT1) SNV und CNV: Short Read NGS
TERT 613989 AR Dyskeratosis congenita (DKCB4) SNV und CNV: Short Read NGS
TINF2 268130 AD Revesz-Syndrom (DKCA5) SNV und CNV: Short Read NGS
TP53 618165 AD Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS5) SNV und CNV: Short Read NGS
TYMS 620040 DD Dyskeratosis congenita (DKCD) SNV und CNV: Short Read NGS
WRAP53 613988 AR Dyskeratosis congenita (DKCB3) SNV und CNV: Short Read NGS
ZCCHC8 618674 AD Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT5) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Knochenmarkinsuffizienz-Syndrom (BMFS)
ADH5, ALDH2, DNAJC21, DUT, ERCC6L2, MDM4, MYSM1, SLC30A7, SRP72, TP53
Telomer-assoziierte Knochenmarkinsuffizienz und/oder Lungenfibrose (PFBMFT)
NAF1, NOP10, PARN, POT1, RPA1, RTEL1, TERC, TERT, ZCCHC8
Dyskeratosis congenita (DKC)
ACD, DCLRE1B, DKC1, NHP2, NOP10, PARN, RTEL1, TERC, TERT, TINF2, TYMS, WRAP53
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ACD, ADH5, ALDH2, DCLRE1B, DKC1, DNAJC21, DUT, EFL1, ERCC6L2, MDM4, MYSM1, NAF1, NHP2, NOP10, PARN, POT1, RPA1, RTEL1, SBDS, SLC30A7, SRP72, TERC, TERT, TINF2, TP53, TYMS, WRAP53, ZCCHC8
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