Leistungsverzeichnis

panel : ID185.01
Kongenitales zentrales Hypoventilationssyndrom (CCHS) : 5 Gene (9,714 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 2 - 4 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
LBX1 619483 AR Undine-Syndrom (CCHS3) SNV und CNV: Short Read NGS
MECP2 300260 XLR Entwicklungsstörung mit CCHS SNV und CNV: Short Read NGS
MYO1H 619482 AR Undine-Syndrom (CCHS2) SNV und CNV: Short Read NGS
PHOX2B 209880 AD Undine-Syndrom (CCHS1) SNV und CNV: Short Read NGS
RET 209880 AD Undine-Syndrom (CCHS) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Kongenitales zentrales Hypoventilationssyndrom (CCHS)
LBX1, MECP2, MYO1H, PHOX2B, RET
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
LBX1, MECP2, MYO1H, PHOX2B, RET
HPO Terms
Central hypoventilation, Apnea, Respiratory insufficiency, Respiratory failure, Abnormality of the autonomic nervous system, Temperature instability, Heat intolerance, Decreased heart rate variability, Feeding difficulties, Feeding difficulties in infancy, Gastroesophageal reflux, Constipation, Neonatal hypotonia, Failure to thrive, Abnormal pattern of respiration, Abnormal temperature regulation, Abnormal autonomic nervous system physiology, Seizure, Hypotonia, Episodic vomiting
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