Leistungsverzeichnis

panel : ID279.00
Fehlbildungssyndrome mit überwiegend fazialer Beteiligung : 25 Gene (90,930 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
C2CD3 615948 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD14) SNV und CNV: Short Read NGS
COL11A2 184840 AD Weissenbacher-Zweymuller-Syndrom (OSMEDA) SNV und CNV: Short Read NGS
CPLANE1 277170 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD6) SNV und CNV: Short Read NGS
DDX59 174300 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD5) SNV und CNV: Short Read NGS
FGFR1 101600 AD Pfeiffer-Syndrom (ACS5) SNV und CNV: Short Read NGS
FGFR2 101200 AD Apert-Syndrom (ACS1) SNV und CNV: Short Read NGS
FGFR2 101200 AD Apert-Crouzon-Syndrom (ACS2) SNV und CNV: Short Read NGS
FGFR2 101600 AD Pfeiffer-Syndrom (ACS5) SNV und CNV: Short Read NGS
FGFR2 123500 AD Crouzon-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
FGFR3 602849 AD Muenke-Syndrom (MNKES) SNV und CNV: Short Read NGS
FRAS1 607830 AR Fraser-Syndrom (FRASRS1) SNV und CNV: Short Read NGS
FREM2 608945 AR Fraser-Syndrom (FRASRS3) SNV und CNV: Short Read NGS
GRIP1 604597 AR Fraser-Syndrom (FRASRS2) SNV und CNV: Short Read NGS
IFT57 617927 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD18) SNV und CNV: Short Read NGS
INTU 617926 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD17) SNV und CNV: Short Read NGS
KIAA0753 617127 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD15) SNV und CNV: Short Read NGS
MEGF8 614976 AR Carpenter-Syndrom (CRPT2) SNV und CNV: Short Read NGS
MYH3 193700 AD Freeman-Sheldon-Syndrom (DA2A) SNV und CNV: Short Read NGS
MYMK 254940 AR Carey-Fineman-Ziter-Syndrom (CFZS) SNV und CNV: Short Read NGS
MYT1 600379 NN Goldenhar-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
OFD1 311200 XLD Orofaziodigitales Syndrom (OFD1) SNV und CNV: Short Read NGS
RAB23 201000 AR Carpenter-Syndrom (CRPT1, ACPS2) SNV und CNV: Short Read NGS
RBM10 311900 XLR TARP-Syndrom (TARPS) SNV und CNV: Short Read NGS
TCTN3 258860 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD4) SNV und CNV: Short Read NGS
TGDS 616145 AR Catel-Manzke-Syndrom (CATMANS) SNV und CNV: Short Read NGS
TMEM107 617563 AR Orofaziodigitales Syndrom (OFD16) SNV und CNV: Short Read NGS
TNNI2 601680 AD Freeman-Sheldon-Syndrom (DA2B1) SNV und CNV: Short Read NGS
TWIST1 101400 AD Saethre-Chotzen-Syndrom (SCS, ACS3) SNV und CNV: Short Read NGS
TWIST1 180750 AD Robinow-Sorauf-Syndrom SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Akrozephalosyndaktylie-Syndrom (ACS)
FGFR1, FGFR2, FGFR3, MEGF8, RAB23, TWIST1
Orofaziodigitales Syndrom (OFD)
C2CD3, CPLANE1, DDX59, IFT57, INTU, KIAA0753, OFD1, TCTN3, TMEM107
Fraser-Syndrom (FRASRS)
FRAS1, FREM2, GRIP1
Pierre-Robin-Syndrom
COL11A2, MYMK, RBM10, TGDS
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
C2CD3, COL11A2, CPLANE1, DDX59, FGFR1, FGFR2, FGFR3, FRAS1, FREM2, GRIP1, IFT57, INTU, KIAA0753, MEGF8, MYH3, MYMK, MYT1, OFD1, RAB23, RBM10, TCTN3, TGDS, TMEM107, TNNI2, TWIST1
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