Leistungsverzeichnis

panel : ID196.02
Distale Arthrogrypose (DA) : 11 Gene (40,347 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
ECEL1 615065 AR DA5D SNV und CNV: Short Read NGS
FBN2 121050 AD DA9 SNV und CNV: Short Read NGS
MYBPC1 614335 AD DA1B SNV und CNV: Short Read NGS
MYH3 193700 AD DA2A SNV und CNV: Short Read NGS
MYH3 618436 AD DA2B3 SNV und CNV: Short Read NGS
MYH8 158300 AD DA7 SNV und CNV: Short Read NGS
MYL11 619110 AD, AR DA1C SNV und CNV: Short Read NGS
PIEZO2 114300 AD DA3 SNV und CNV: Short Read NGS
PIEZO2 108145 AD DA5 SNV und CNV: Short Read NGS
TNNI2 601680 AD DA2B1 SNV und CNV: Short Read NGS
TNNT3 193700 AD DA2B2 SNV und CNV: Short Read NGS
TPM2 108120 AD DA1A SNV und CNV: Short Read NGS
TPM2 108120 AD DA2B4 SNV und CNV: Short Read NGS
UBA1 301830 XLR DA (SMAX2) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Distale Arthrogrypose (DA)
ECEL1, FBN2, MYBPC1, MYH3, MYH3, MYH8, MYL11, PIEZO2, PIEZO2, TNNI2, TNNT3, TPM2, TPM2, UBA1
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
ECEL1, FBN2, MYBPC1, MYH3, MYH8, MYL11, PIEZO2, TNNI2, TNNT3, TPM2, UBA1
HPO Terms
Distal arthrogryposis, Multiple joint contractures, Camptodactyly, Congenital finger flexion contractures, Limited finger flexion contracture, Distal muscle weakness, Generalized hypotonia, Short stature, High, narrow palate, Cleft palate, Micrognathia, Ptosis, Congenital hip dislocation, Talipes equinovarus, Calcaneovalgus deformity, Camptodactyly of toe, Hip contracture, Joint contracture of the hand, Abnormal cardiovascular system morphology, Abnormal skeletal morphology
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