Leistungsverzeichnis

panel : ID227.00
Spondylokostale Dysostose (SCDO) : 7 Gene (14,376 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
DLL3 277300 AR SCDO1 SNV und CNV: Short Read NGS
FLNB 272460 AR Spondylokarpotarsale Synostose (SCT) SNV und CNV: Short Read NGS
HES7 613686 AR SCDO4 SNV und CNV: Short Read NGS
LFNG 609813 AR SCDO3 SNV und CNV: Short Read NGS
MESP2 608681 AR SCDO2 SNV und CNV: Short Read NGS
RIPPLY2 616566 AR SCDO6 SNV und CNV: Short Read NGS
TBX6 122600 AR, AD SCDO5 SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Spondylokostale Dysostose (SCDO)
DLL3, FLNB, HES7, LFNG, MESP2, RIPPLY2, TBX6
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
DLL3, FLNB, HES7, LFNG, MESP2, RIPPLY2, TBX6
HPO Terms
Vertebral segmentation defect, Abnormal morphology of vertebral bodies, Abnormal rib morphology, Rib fusion, Rib spur, Short thorax, Short trunk, Short stature, Scoliosis, Kyphosis, Kyphoscoliosis, Respiratory insufficiency, Abnormal rib segmentation abnormalities, Abnormal intervertebral disk morphology, Abnormal cervical curvature, Vertebral fusion, Abnormal morphology of the cervical spine, Short neck, Abnormal cardiovascular system morphology, Vertebral hypoplasia
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