Leistungsverzeichnis - Chromosomen-Instabilitätssyndrome : 40 Gene (120,972 kb)

Material	Dauer	Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut	4 - 6 Wochen	ja

Untersuchte Bereiche / Gene

Genotyp	OMIM-P	Erbgang	Phänotyp	Methodik
ANAPC1	618625	AR	Rothmund-Thomson-Syndrom (RTS1)	SNV und CNV: Short Read NGS
ATM	208900	AR	Ataxia teleangiectatica (AT)	SNV und CNV: Short Read NGS
BLM	210900	AR	Bloom-Syndrom (BLM, MGRISCE1)	SNV und CNV: Short Read NGS
BRCA1	227650	AR	Fanconi-Anämie (FANCS)	SNV und CNV: Short Read NGS
BRCA2	605724	AR	Fanconi-Anämie (FANCD1)	SNV und CNV: Short Read NGS
BRIP1	609054	AR	Fanconi-Anämie (FANCJ)	SNV und CNV: Short Read NGS
DDB2	278740	AR	Xeroderma pigmentosum (XPE)	SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC2	278730	AR	Xeroderma pigmentosum (XPD)	SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC3	610651	AR	Xeroderma pigmentosum (XPB)	SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC4	615272	AR	Fanconi-Anämie (FANCQ)	SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC4	278760	AR	Xeroderma pigmentosum (XPF)	SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC5	278780	AR	Xeroderma pigmentosum (XPG)	SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC6	133540	AR	Xeroderma pigmentosum, (XP/CSB)	SNV und CNV: Short Read NGS
ERCC8	216400	AR	Xeroderma pigmentosum, (XP/CSA)	SNV und CNV: Short Read NGS
FANCA	227650	AR	Fanconi-Anämie (FANCA)	SNV und CNV: Short Read NGS
FANCB	300514	XLR	Fanconi-Anämie (FANCB)	SNV und CNV: Short Read NGS
FANCC	227645	AR	Fanconi-Anämie (FANCC)	SNV und CNV: Short Read NGS
FANCD2	227646	AR	Fanconi-Anämie (FANCD2)	SNV und CNV: Short Read NGS
FANCE	600901	AR	Fanconi-Anämie (FANCE)	SNV und CNV: Short Read NGS
FANCF	603467	AR	Fanconi-Anämie (FANCF)	SNV und CNV: Short Read NGS
FANCG	614082	AR	Fanconi-Anämie (FANCG)	SNV und CNV: Short Read NGS
FANCI	609053	AR	Fanconi-Anämie (FANCI)	SNV und CNV: Short Read NGS
FANCL	614083	AR	Fanconi-Anämie (FANCL)	SNV und CNV: Short Read NGS
MAD2L2	617243	AR	Fanconi-Anämie (FANCV)	SNV und CNV: Short Read NGS
MRE11	604391	AR	Ataxia teleangiectatica-ähnliches Syndrom (ATLD1)	SNV und CNV: Short Read NGS
NBN	251260	AR	Nijmegen-Breakage-Syndrom (NBS)	SNV und CNV: Short Read NGS
PALB2	610832	AR	Fanconi-Anämie (FANCN)	SNV und CNV: Short Read NGS
PCNA	615919	AR	Ataxia teleangiectatica-ähnliches Syndrom (ATLD2)	SNV und CNV: Short Read NGS
POLH	278750	AR	Xeroderma pigmentosum, (XPV)	SNV und CNV: Short Read NGS
RAD50	613078	AR	Nijmegen-Breakage-ähnliches Syndrom (NBSLD)	SNV und CNV: Short Read NGS
RAD51	617244	AD	Fanconi-Anämie (FANCR)	SNV und CNV: Short Read NGS
RAD51C	613390	AR	Fanconi-Anämie (FANCO)	SNV und CNV: Short Read NGS
RECQL4	268400	AR	Rothmund-Thomson-Syndrom (RTS2)	SNV und CNV: Short Read NGS
RFWD3	617784	AR	Fanconi-Anämie (FANCW)	SNV und CNV: Short Read NGS
SLX4	613951	AR	Fanconi-Anämie (FANCP)	SNV und CNV: Short Read NGS
TOP3A	618097	AR	Bloom-Syndrom (MGRISCE2)	SNV und CNV: Short Read NGS
UBE2T	616435	AR	Fanconi-Anämie (FANCT)	SNV und CNV: Short Read NGS
WRN	277700	AR	Werner-Syndrom (WRN)	SNV und CNV: Short Read NGS
XPA	278700	AR	Xeroderma pigmentosum (XPA)	SNV und CNV: Short Read NGS
XPC	278720	AR	Xeroderma pigmentosum (XPC)	SNV und CNV: Short Read NGS
XRCC2	617247	AR	Fanconi-Anämie (FANCU)	SNV und CNV: Short Read NGS

Methodik

ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.

Chromosomen-Instabilitätssyndrome

ANAPC1, ATM, BLM, BRCA1, BRCA2, BRIP1, DDB2, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC4, ERCC5, ERCC6, ERCC8, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, MAD2L2, MRE11, NBN, PALB2, PCNA, POLH, RAD50, RAD51, RAD51C, RECQL4, RFWD3, SLX4, TOP3A, UBE2T, WRN, XPA, XPC, XRCC2

Kosten

Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.

Gesamte Genliste

ANAPC1, ATM, BLM, BRCA1, BRCA2, BRIP1, DDB2, ERCC2, ERCC3, ERCC4, ERCC5, ERCC6, ERCC8, FANCA, FANCB, FANCC, FANCD2, FANCE, FANCF, FANCG, FANCI, FANCL, MAD2L2, MRE11, NBN, PALB2, PCNA, POLH, RAD50, RAD51, RAD51C, RECQL4, RFWD3, SLX4, TOP3A, UBE2T, WRN, XPA, XPC, XRCC2

HPO Terms

Microcephaly, Growth retardation, Developmental delay, Intellectual disability, Abnormality of the immune system physiology, Increased sensitivity to ionizing radiation, Ataxia, Telangiectasia, Skin rash, Leukemia, Lymphoma, Bone marrow hypocellularity, Thrombocytopenia, Anemia, Neutropenia, Hypogonadism, Abnormal facial shape, Facial asymmetry, Developmental cataract, Short stature