Leistungsverzeichnis

panel : ID362.00
Konstitutionelles MMR-Defizienz-Syndrom (CMMRDS, MMRCS) : 5 Gene (12,693 kb)
Ihr regionales Labor für Rückfragen und Beauftragung
Material Dauer Akkreditierung
3 - 5 ml EDTA-Blut 3 - 5 Wochen ja
Untersuchte Bereiche / Gene
Genotyp OMIM-P Erbgang Phänotyp Methodik
EPCAM 619096 AR Mismatch-Reparatur-Krebssyndrom (MMRCS2, CMMRDS) SNV und CNV: Short Read NGS
MLH1 276300 AR Mismatch-Reparatur-Krebssyndrom (MMRCS1, CMMRDS) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH2 619096 AR Mismatch-Reparatur-Krebssyndrom (MMRCS2, CMMRDS) SNV und CNV: Short Read NGS
MSH6 619097 AR Mismatch-Reparatur-Krebssyndrom (MMRCS3, CMMRDS) SNV und CNV: Short Read NGS
PMS2 619101 AR Mismatch-Reparatur-Krebssyndrom (MMRCS4, CMMRDS) SNV und CNV: Short Read NGS
Methodik
ROI: complete Reference cDNA includierend +/-20bp exon intron Grenze plus Custom Spike-in (Sonden für intronische und regulatorische Varianten der Klassen 4 und 5 aus HGMD- und ClinVar-Annotation, Stand 01/2025). Library: Capture based TWIST Library Sequenzierung: Aviti, Illumina- NovaSeq6000 oder NovaseqX Sequencer Variantenklassifikation gemäß ACMG-Guidelines (Richards et al. 2015, PMID: 25741868) sowie, falls verfügbar, Gen-spezifischer Guidelines (https://cspec.genome.network/cspec/ui/svi) Varianten unklarer Signifikanz (VUS) werden nur berichtet, wenn sie als klinisch relevant angesehen werden Punktesystem nach Tavtigian et al., 2020, PMID: 32720330): „hot“ VUS: 5 Punkte; „warm“ VUS: 4 Punkte; „tepid“ VUS: 3 Punkte; „cool“ VUS: 2 Punkte; „cold“ VUS: 1 Punkt; „ice cold“ VUS: 0 Punkte). Bestätigung des NGS-Ergebnisses wird für krankheitsauslösende Varianten mittels konventioneller Sanger-Sequenzierung durchgeführt, sofern die internen Qualitätskriterien nicht erfüllt sind. Limitationen: Varianten (SNV/InDels) werden ab einer Allelfrequenz von >25% nachgewiesen. Größere Insertionen/Deletionen oder InDels können unter Umständen nicht detektiert werden, da sie als nicht-passende Bereiche vom Mapping-Algorithmus entfernt werden. Nicht alle potentiell relevanten Bereiche der untersuchten Gene (z. B. regulatorische Bereiche, Introns) können komplett abgedeckt werden. Strukturaberration oder Keimbahnmosaike können nicht ausgeschlossen werden. Bereiche mit schwierigen Sequenzbereichen wie z.B. repetitiven Sequenzen oder homologen Bereichen (LINEs, SINEs, Alu-Elemente, Pseudogenen oder Trinukleotid-Repeats) mit deutlich eingeschränkten Nachweisgrenze.
Konstitutionelles MMR-Defizienz-Syndrom (CMMRDS, MMRCS)
EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, PMS2
Kosten
Die Kosten werden bei bestehender medizinischer Indikation über einen Überweisungsschein Typ 10 (EBM) abgerechnet. Humangenetische Leistungen sind nicht budgetrelevant. Für privatversicherte Patienten sowie private Kostenträger (Krankenhäuser etc.) können auf Wunsch entsprechende Kostenvoranschläge erstellt werden.
Gesamte Genliste
EPCAM, MLH1, MSH2, MSH6, PMS2
HPO Terms
Multiple cafe-au-lait spots, Axillary freckling, Seizure, Visual impairment, Increased intracranial pressure, Gait disturbance, Dysarthria, Hypotonia, Glioblastoma multiforme, Medulloblastoma, Astrocytoma, Pleomorphic xanthoastrocytoma, Ependymoma, Oligodendroglioma, Leukemia, Lymphoma, T-cell acute lymphoblastic leukemias, Adenocarcinoma of the colon, Adenocarcinoma of the small intestine
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